В соответствии с приказом Федеральной службы по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды от 11.10.2012 года № 610 «О реорганизации ФГБУ, подведомственных Департаменту Федеральной службы по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды по Приволжскому федеральному округу» в результате реорганизации в форме слияния подведомственных Департаменту Федеральной службы по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды по Приволжскому федеральному округу Федерального государственного бюджетного учреждения «Нижегородский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды с региональными функциями», Федерального государственного бюджетного учреждения «Кировский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды», Федерального государственного бюджетного учреждения «Марийский республиканский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды», Федерального государственного бюджетного учреждения «Мордовский республиканский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды», Федерального государственного бюджетного учреждения «Удмуртский республиканский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды», Федерального государственного бюджетного учреждения «Чувашский республиканский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» было создано Федеральное государственное бюджетное учреждение «Верхне-Волжское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» (ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС»).
В связи с вышеизложенным с 11 января 2013 г. все права и обязанности Федерального государственного бюджетного учреждения «Нижегородский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды с региональными функциями» в полном объеме переходят к правопреемнику ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС».
В составе ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС» образованы филиалы: Кировский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды – филиал Федерального государственного бюджетного учреждения «Верхне-Волжское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» (Кировский ЦГМС – филиал ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС»), Марийский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды – филиал Федерального государственного бюджетного учреждения «Верхне-Волжское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» (Марийский ЦГМС – филиал ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС»), Мордовский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды – филиал Федерального государственного бюджетного учреждения «Верхне-Волжское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» (Мордовский ЦГМС – филиал ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС»), Удмуртский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды – филиал Федерального государственного бюджетного учреждения «Верхне-Волжское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» (Удмуртский ЦГМС – филиал ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС»), Чувашский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды – филиал Федерального государственного бюджетного учреждения «Верхне-Волжское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» (Чувашский ЦГМС – филиал ФГБУ «Верхне-Волжское УГМС»).